BLAST kompüter alqoritmidir Milli Biotexnologiya İnformasiya Mərkəzinin (NCBI) veb-saytında, eləcə də bir çox başqa saytlarda onlayn istifadə etmək mümkündür. BLAST sorğu DNT ardıcıllığını ardıcıllıq verilənlər bazası ilə sürətlə uyğunlaşdıra və müqayisə edə bilər ki, bu da onu davam edən genomik tədqiqatlarda mühüm alət edir.
BLAST əsas verilənlər bazasıdır?
BLAST bioinformatika tədqiqatlarında ən çox istifadə olunan proqramdır. Onun əsas funksiyası maraq ardıcıllığını, sorğu ardıcıllığını böyük verilənlər bazasındakı ardıcıllıqla müqayisə etməkdir BLAST, sonra verilənlər bazasında tapılan ən yaxşı uyğunluqları və ya "hitləri" bildirir. Bu sadə proqramın iki əsas tətbiqi var.
NCBI verilənlər bazasıdır?
NCBI biotexnologiya və biotibb ilə əlaqəli bir sıra verilənlər bazasına malikdir və bioinformatika alətləri və xidmətləri üçün mühüm mənbədir. Əsas məlumat bazalarına DNT ardıcıllığı üçün GenBank və biotibbi ədəbiyyat üçün biblioqrafik verilənlər bazası olan PubMed daxildir. Digər verilənlər bazalarına NCBI Epigenomics verilənlər bazası daxildir.
BLAST yalnız NCBI verilənlər bazalarında istifadə olunur?
BLAST internetdə NCBI saytında üzərində mövcuddur. Sorğu ardıcıllığına və hədəf verilənlər bazasına görə müxtəlif növ BLAST mövcuddur.
BLAST verilənlər bazası necə işləyir?
BLAST necə işləyir? BLAST evristik metoddan istifadə edərək homoloji ardıcıllığı müəyyən edir ilkin olaraq iki ardıcıllıq arasında qısa uyğunluqlar tapır; beləliklə, metod bütün ardıcıllıq sahəsini nəzərə almır. İlkin matçdan sonra BLAST bu ilkin uyğunluqlardan yerli düzülmələrə başlamağa çalışır.
