Koformasiya entropiyasının itirilməsi zülal qatlanmasının termodinamikasında böyük töhfədir Bununla belə, miqdarın dəqiq müəyyən edilməsinin çətinliyi sübut edilmişdir. Biz bu itkini həm yerli zülalın, həm də real denatürasiya edilmiş dövlət ansamblının molekulyar dinamik simulyasiyalarından istifadə edərək hesablayırıq.
Konformasiya entropiya zülalı nədir?
Konformasiya entropiyası molekulun konformasiyalarının sayı ilə əlaqəli entropiyadır. … Zülallarda, onurğa dihedral bucaqları və yan zəncir rotamerləri adətən parametrlər kimi istifadə olunur və RNT-də əsas cütləşmə nümunəsi istifadə edilə bilər.
Hansının daha böyük konformasiya entropiyası qatlanmış zülal və ya açılmamış?
Polipeptid zəncirinin konformasiya entropiyası açılmamış vəziyyət üçün daha çox məhdud konformasiya məkanı ilə xarakterizə edilən daha yığcam qatlanmış vəziyyətlə müqayisədə daha böyükdür. Buna görə də, bu töhfə açılmamış vəziyyəti stabilləşdirir (ΔSconf > 0).
Zülalın konformasiyasını nə müəyyənləşdirir və zülal qatlanması ilə bağlı problem nədir?
Zülalın ilkin strukturu, onun xətti aminturşu ardıcıllığı onun yerli konformasiyasını müəyyən edir. Xüsusi amin turşusu qalıqları və onların polipeptid zəncirindəki mövqeyi zülalın hissələrinin bir-birinə sıx şəkildə qatlanması və onun üçölçülü konformasiyasını meydana gətirməsi üçün müəyyənedici amillərdir.
Zülalın qatlanmasına hansı amillər təsir edir?
Protein qatlanması çox həssas prosesdir və bu prosesə elektrik və maqnit sahələri, temperatur, pH, kimyəvi maddələr, məkan məhdudiyyəti və molekulyar sıxlıq daxil olmaqla bir sıra xarici amillər təsir edir. Bu amillər Zülalların düzgün funksional formalarına qatlanma qabiliyyətinə təsir göstərir.
