Homoloji modelləşdirmə şablon və hədəf ardıcıllıqları arasındakı oxşarlığa əsaslanaraq hədəf zülalın üçölçülü strukturunu əldə edir və membran zülallarının öyrənilməsi zamanı bu texnikanın effektivliyi sübuta yetirilir. … daha yüksək səviyyədə başa düşülməsini təmin etdiyi üçün GPCR kimi kristallaşmaq çətindir.
Homoloji modelləşdirmə nədir və nə üçün lazımdır?
1.2.
Homoloji modelləşdirmə etibarlı struktur modelləri yaratmaq üçün ən dəqiq hesablama üsuludur və bir çox bioloji tətbiqlərdə adətən istifadə olunur. Homoloji modelləşdirmə şablon zülalların ardıcıl düzülüşü vasitəsilə sorğu zülalının 3D strukturunu proqnozlaşdırır.
Homoloji Modelləşdirmə prinsipi nədir?
Homoloji modelləşdirmə həm də müqayisəli modelləşdirmə kimi tanınır, məlum strukturlarla ardıcıllıq homologiyasına əsaslanan protein strukturlarını proqnozlaşdırır. Bu, " iki zülal kifayət qədər yüksək ardıcıllıqla oxşarlığı paylaşırsa, onların çox oxşar üçölçülü strukturlara malik olma ehtimalı var" prinsipinə əsaslanır.
Yaxşı homoloji Modelləşdirməni nə edir?
Əgər "yüksək uğurlu homologiya modeli"ni empirik strukturdan <=2 Å rmsd olan model kimi təyin etsək, o zaman şablon uğur üçün hədəflə >=60% ardıcıllıq eyniliyinə malik olmalıdır. dərəcəsi >70% Hətta yüksək ardıcıllıqla eyniləşdirmələrdə (60%-95%), hər on homoloji modeldən birində rmsd var >5 Å vs.
Aşağıdakılardan hansı homoloji Modelləşdirmə haqqında doğrudur?
İzahat: Adından da göründüyü kimi, homologiya modelləşdirmə məlum strukturlarla ardıcıllıq homologiyasına əsaslanan zülal strukturlarını proqnozlaşdırır Homologiya modelləşdirmə şablon zülallarla uyğunlaşmaya əsaslanan bütün atom modelini yaradır.… Düzləşdirmə addımında edilən xətalar aşağıdakı modelləşdirmə addımlarında düzəldilə bilməz.
